Ở bể bơi, các chất gây ô nhiễm được phát tán từ các nguồn môi trường và bơi lội những ảnh hưởng đến chủ yếu là các bể bơi ngoài trời, các chất gây ô nhiễm môi trường bao gồm bụi bẩn, các mảnh vụn, nước đến từ các nguồn mất vệ sinh, mưa có chứa các bào tử và vi tảo phân từ các loài chim có thể chứa chấp vi trùng gây bệnh. (riêng bể bơi trong nhà là tương đối an toàn).Chất gây ô nhiễm được truyền nhiễm bởi những người bơi lội có thể ảnh hưởng đáng kể các hoạt động của các bể bơi trong nhà và ngoài trời. Nguồn bao gồm các vi sinh vật từ những người bơi lội bị nhiễm bệnh và các loại dịch tiết từ cơ thể bao gồm mồ hôi, mỹ phẩm, kem chống nắng, nước tiểu, nước bọt và phân. Ngoài ra, sự tương tác giữa chất khử trùng và các chất gây ô nhiễm nước hồ bơi có thể tạo ra một hỗn hợp của chloramines và có thể gây hại.

Chất gây ô nhiễm gây bệnh là mối quan tâm lớn nhất trong các bể bơi. các tác nhân gây bệnh y tế công cộng có thể có mặt trong các bể bơi như virus, vi khuẩn, động vật nguyên sinh và nấm. Tiêu chảy là thường gặp nhất bệnh liên quan đến các chất gây ô nhiễm gây bệnh, trong khi các bệnh khác liên quan với các hồ bơi không được điều trị. Các bệnh khác thường xảy ra trong các bể bơi kém chất lượng bao gồm viêm tai, phát ban da và nhiễm trùng đường hô hấp.